METODOLOGIE DIAGNOSTICHE DI BIOCHIMICA CLINICA E DI BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA
Anno accademico 2018/2019 - 3° anno- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA': Vittorio Calabrese
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE: Massimo Libra
SSD
- BIO/12 - Biochimica clinica e Biologia molecolare clinica
- MED/46 - Scienze tecniche di Medicina di laboratorio
Semestre: 1°
ENGLISH VERSION
Obiettivi formativi
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Scopo del corso è di far conoscere agli studenti la terminologia relata all’inquinamento ambientale, fornire le basi per comprenderne le ragioni, gli effetti e i costi e fargli apprendere le tecniche di analisi, dirette e indirette, degli inquinanti nell’aria, nell’acqua e nel suolo. Nell’ambito del corso verranno affrontati gli argomenti propedeutici per consolidare sia le conoscenze di base, che quelle relative alle basi teoriche e metodologiche. Inoltre, scopo del corso è di far conoscere agli studenti la terminologia relativa all’inquinamento ambientale, fornire le basi per comprenderne le ragioni, gli effetti e i costi e fargli apprendere le tecniche di analisi, dirette e indirette, degli inquinanti nell’aria, nell’acqua e nel suolo. Nell’ambito del corso verranno affrontati gli argomenti propedeutici per consolidare sia le conoscenze di base, che quelle relative alle basi teoriche e metodologiche.
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
Gli obiettivi formativi specifici del Corso di Metodologie diagnostiche di Laboratorio sono quelli di consentire allo studente l’acquisizione delle nozioni fondamentali per la valutazione critica e l’interpretazione dei risultati delle principali tecniche diagnostiche e biomolecolari utilizzate nella pratica clinica e nella ricerca di base.
Modalità di svolgimento dell'insegnamento
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Lezione frontali con slides mostrate durante l’attività didattica messe a disposizione durante il corso, elaborati e ricerche individuali.
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
L'insegnamento verrà svolto mediante l'erogazione di lezioni di didattica frontale da svolgere in aula più esercitazioni di laboratorio da svolgere presso i laboratori didattici della Torre Biologica per integrare le conoscenze teoriche acquisite durante le ore svolte in aula.
Prerequisiti richiesti
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Conoscenza dei fondamenti di Biologia e Chimica
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
Nessuno
Frequenza lezioni
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Obbligatoria
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
Obbligatoria
Contenuti del corso
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
1.Definizione di Ambiente, Inquinamento.
2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo).
3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie).
4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno)
5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo.
6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento.
7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratogenesi, Tossicologici, da Irritanti, da Caustici).
8.Tecniche di riduzione dell’inquinamento.
9.Classificazione delle composizioni aria-inquinante: gas e vapori; esalazioni; fumi; polveri; smog.
10.Inquinanti primari e secondari. Indici di qualità dell’aria. Effetto serra. Piogge acide. L’Inquinamento dell’acqua. 11.Modalità di inquinamento.
12.Tossicità dei metalli.
13.Tipologia degli inquinanti chimici: organici ed inorganici: pesticidi e fertilizzanti.
14.Definizione di Ambiente, definizione di inquinamento.
15.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo).
16.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie).
17.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno)
18.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo.
19.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento.
20.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratogenesi, Tossicologici, da Irritanti, da Caustici).
21.Tecniche di riduzione dell’inquinamento.
22.Classificazione delle composizioni aria-inquinante: gas e vapori; esalazioni; fumi; polveri; smog.
23.Inquinanti primari e secondari. Indici di qualità dell’aria. Effetto serra. Piogge acide. L’Inquinamento dell’acqua. 11.Modalità di inquinamento.
24.Tossicità dei metalli.
25.Tipologia degli inquinanti chimici: organici ed inorganici: pesticidi e fertilizzanti.
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
1. Sequenziamento di prima generazione: Metodo Sanger e Pirosequenziamento.
2. Microarray di espressione genica.
3. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 1/2
4. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454
5. Digital Droplet PCR.
6. Ruolo del Microbiota e sue implicazioni nelle patologie oncologiche e neuropsichiatriche
7. Consultazione della letteratura scientifica e progettazione di primers per PCR.
Testi di riferimento
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Chimica ambientale di Colin Baird, Michael Cann, Zanichelli. ISBN: 880817378X
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
1) Widmann: Interpretazione clinica degli esami di laboratorio. Ronald A. Sacher e Richard A. McPherson. 2001 Undicesima edizione. Mc Graw Hill libri Italia (Milano)
2) Giorgio Federici: Medicina di Laboratorio. 2008 Terza edizione. Mc Graw Hill libri Italia (Milano)
Programmazione del corso
BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA' | |||
Argomenti | Riferimenti testi | ||
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1 | 1.Definizione di Ambiente, definizione di inquinamento. 2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo). 3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie). 4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno) 5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo. 6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento. 7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Muta | Chimica ambientale di Colin Baird, Michael Cann, Zanichelli. ISBN: 880817378X | |
2 | 1.Definizione di Ambiente, Inquinamento. 2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo). 3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie). 4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno) 5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo. 6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento. 7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratog | ||
METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE | |||
Argomenti | Riferimenti testi | ||
1 | 1. Sequenziamento di prima generazione: Metodo Sanger e Pirosequenziamento | ||
2 | 2. Microarray di espressione genica. | ||
3 | 3. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 1/2 | ||
4 | 4. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454 | ||
5 | 4. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454 | ||
6 | 5. Droplet Digital PCR. | ||
7 | 6. Ruolo del Microbiota e sue implicazioni nelle patologie oncologiche e neuropsichiatriche | ||
8 | 7. Consultazione della letteratura scientifica e progettazione di primers per PCR. |
Verifica dell'apprendimento
Modalità di verifica dell'apprendimento
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Esame Orale
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
L'esame consiste di un test scritto a risposta multipla e di un esame orale per valutare la preparazione dello studente sulle tematiche trattate a lezione.
Esempi di domande e/o esercizi frequenti
- BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
Tipi di Inquinamento
2. Inquinamento chimico, fisico e biologico
3. Effetti delle sostanze inquinanti sull’aria, l’acqua ed il suolo
4. Cicli biogeochimici (carbonio, ossigeno, fosforo, azoto, zolfo)
5. Tipologia degli inquinanti
- METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
- Principali differenze tra sequenziamento di prima generazione e Next Generation Sequencing.
- Flusso di lavoro della droplet digital PCR.
- Ruolo del microbiota intestinale nelle patologie oncologiche