METODOLOGIE DIAGNOSTICHE DI BIOCHIMICA CLINICA E DI BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

Anno accademico 2018/2019 - 3° anno
Docenti
  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA': Vittorio Calabrese
  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE: Massimo Libra
Crediti: 6
SSD
  • BIO/12 - Biochimica clinica e Biologia molecolare clinica
  • MED/46 - Scienze tecniche di Medicina di laboratorio
Organizzazione didattica: 150 ore d'impegno totale, 108 di studio individuale, 42 di lezione frontale
Semestre:
ENGLISH VERSION

Obiettivi formativi

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Scopo del corso è di far conoscere agli studenti la terminologia relata all’inquinamento ambientale, fornire le basi per comprenderne le ragioni, gli effetti e i costi e fargli apprendere le tecniche di analisi, dirette e indirette, degli inquinanti nell’aria, nell’acqua e nel suolo. Nell’ambito del corso verranno affrontati gli argomenti propedeutici per consolidare sia le conoscenze di base, che quelle relative alle basi teoriche e metodologiche. Inoltre, scopo del corso è di far conoscere agli studenti la terminologia relativa all’inquinamento ambientale, fornire le basi per comprenderne le ragioni, gli effetti e i costi e fargli apprendere le tecniche di analisi, dirette e indirette, degli inquinanti nell’aria, nell’acqua e nel suolo. Nell’ambito del corso verranno affrontati gli argomenti propedeutici per consolidare sia le conoscenze di base, che quelle relative alle basi teoriche e metodologiche.

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    Gli obiettivi formativi specifici del Corso di Metodologie diagnostiche di Laboratorio sono quelli di consentire allo studente l’acquisizione delle nozioni fondamentali per la valutazione critica e l’interpretazione dei risultati delle principali tecniche diagnostiche e biomolecolari utilizzate nella pratica clinica e nella ricerca di base.


Modalità di svolgimento dell'insegnamento

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Lezione frontali con slides mostrate durante l’attività didattica messe a disposizione durante il corso, elaborati e ricerche individuali.

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    L'insegnamento verrà svolto mediante l'erogazione di lezioni di didattica frontale da svolgere in aula più esercitazioni di laboratorio da svolgere presso i laboratori didattici della Torre Biologica per integrare le conoscenze teoriche acquisite durante le ore svolte in aula.


Prerequisiti richiesti

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Conoscenza dei fondamenti di Biologia e Chimica

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    Nessuno


Frequenza lezioni

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Obbligatoria

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    Obbligatoria


Contenuti del corso

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    1.Definizione di Ambiente, Inquinamento.

    2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo).

    3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie).

    4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno)

    5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo.

    6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento.

    7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratogenesi, Tossicologici, da Irritanti, da Caustici).

    8.Tecniche di riduzione dell’inquinamento.

    9.Classificazione delle composizioni aria-inquinante: gas e vapori; esalazioni; fumi; polveri; smog.

    10.Inquinanti primari e secondari. Indici di qualità dell’aria. Effetto serra. Piogge acide. L’Inquinamento dell’acqua. 11.Modalità di inquinamento.

    12.Tossicità dei metalli.

    13.Tipologia degli inquinanti chimici: organici ed inorganici: pesticidi e fertilizzanti.

    14.Definizione di Ambiente, definizione di inquinamento.

    15.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo).

    16.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie).

    17.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno)

    18.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo.

    19.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento.

    20.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratogenesi, Tossicologici, da Irritanti, da Caustici).

    21.Tecniche di riduzione dell’inquinamento.

    22.Classificazione delle composizioni aria-inquinante: gas e vapori; esalazioni; fumi; polveri; smog.

    23.Inquinanti primari e secondari. Indici di qualità dell’aria. Effetto serra. Piogge acide. L’Inquinamento dell’acqua. 11.Modalità di inquinamento.

    24.Tossicità dei metalli.

    25.Tipologia degli inquinanti chimici: organici ed inorganici: pesticidi e fertilizzanti.

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    1. Sequenziamento di prima generazione: Metodo Sanger e Pirosequenziamento.

    2. Microarray di espressione genica.

    3. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 1/2

    4. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454

    5. Digital Droplet PCR.

    6. Ruolo del Microbiota e sue implicazioni nelle patologie oncologiche e neuropsichiatriche

    7. Consultazione della letteratura scientifica e progettazione di primers per PCR.


Testi di riferimento

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Chimica ambientale di Colin Baird, Michael Cann, Zanichelli. ISBN: 880817378X

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    1) Widmann: Interpretazione clinica degli esami di laboratorio. Ronald A. Sacher e Richard A. McPherson. 2001 Undicesima edizione. Mc Graw Hill libri Italia (Milano)

    2) Giorgio Federici: Medicina di Laboratorio. 2008 Terza edizione. Mc Graw Hill libri Italia (Milano)


Programmazione del corso

BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'
 ArgomentiRiferimenti testi
11.Definizione di Ambiente, definizione di inquinamento. 2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo). 3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie). 4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno) 5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo. 6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento. 7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, MutaChimica ambientale di Colin Baird, Michael Cann, Zanichelli. ISBN: 880817378X 
21.Definizione di Ambiente, Inquinamento. 2.Cicli biogeochimici (carbonio, azoto, ossigeno, fosforo, zolfo). 3.Tipi di Inquinamento (Chimico, Biochimico; Microbiologico; Parassitologico; Radioattivo; Acustico; Luminoso; Termico; da Polveri; da Fumi; da Energie). 4.Agenti causali di inquinamento chimico (interno ed esterno) 5.Aspetti specifici dell’inquinamento dell’aria, dell’acqua e del suolo. 6.Effetti diretti e indiretti dell’inquinamento. 7.Tipi di danno alla salute (Carcinogenesi, Mutagenesi, Teratog 
METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE
 ArgomentiRiferimenti testi
11. Sequenziamento di prima generazione: Metodo Sanger e Pirosequenziamento 
22. Microarray di espressione genica. 
33. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 1/2 
44. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454 
54. Sequenziamento di nuova generazione NGS – Tecnologia Illumina pt 2/2 e Roche 454 
65. Droplet Digital PCR. 
76. Ruolo del Microbiota e sue implicazioni nelle patologie oncologiche e neuropsichiatriche 
87. Consultazione della letteratura scientifica e progettazione di primers per PCR. 

Verifica dell'apprendimento

Modalità di verifica dell'apprendimento

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Esame Orale

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    L'esame consiste di un test scritto a risposta multipla e di un esame orale per valutare la preparazione dello studente sulle tematiche trattate a lezione.


Esempi di domande e/o esercizi frequenti

  • BIOCHIMICA E CHIMICA DELL'INQUINAMENTO, TECNICHE DI ANALISI CHIMICO CLINICHE E CONTROLLO DI QUALITA'

    Tipi di Inquinamento

     

    2. Inquinamento chimico, fisico e biologico

     

    3. Effetti delle sostanze inquinanti sull’aria, l’acqua ed il suolo

     

    4. Cicli biogeochimici (carbonio, ossigeno, fosforo, azoto, zolfo)

    5. Tipologia degli inquinanti

  • METODOLOGIA DIAGNOSTICA MOLECOLARE

    - Principali differenze tra sequenziamento di prima generazione e Next Generation Sequencing.

    - Flusso di lavoro della droplet digital PCR.

    - Ruolo del microbiota intestinale nelle patologie oncologiche